Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.2 ms