Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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