Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRFP10586 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRFP10586 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms