Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN9O95484 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN9O95484 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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