Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LRRTM2O43300 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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