Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ERVV-2B6SEH9 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ERVV-2B6SEH9 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.4 ms