Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD3Q9NX63 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CHCHD3Q9NX63 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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