Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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LHX9Q9NQ69 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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LHX9Q9NQ69 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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LHX9Q9NQ69 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
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LHX9Q9NQ69 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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LHX9Q9NQ69 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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LHX9Q9NQ69 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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