Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TIMMDC1Q9NPL8 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms