Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.38
SEH1LQ96EE3 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SEH1LQ96EE3 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
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