Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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TOP1MTQ969P6 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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TOP1MTQ969P6 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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TOP1MTQ969P6 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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TOP1MTQ969P6 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
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TOP1MTQ969P6 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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TOP1MTQ969P6 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TOP1MTQ969P6 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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