Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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