Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ME3Q16798 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ME3Q16798 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ME3Q16798 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ME3Q16798 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ME3Q16798 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ME3Q16798 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ME3Q16798 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ME3Q16798 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ME3Q16798 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ME3Q16798 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ME3Q16798 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ME3Q16798 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ME3Q16798 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ME3Q16798 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ME3Q16798 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ME3Q16798 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ME3Q16798 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ME3Q16798 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ME3Q16798 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ME3Q16798 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ME3Q16798 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ME3Q16798 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ME3Q16798 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ME3Q16798 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ME3Q16798 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ME3Q16798 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ME3Q16798 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ME3Q16798 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ME3Q16798 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ME3Q16798 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ME3Q16798 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ME3Q16798 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ME3Q16798 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ME3Q16798 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ME3Q16798 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ME3Q16798 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ME3Q16798 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ME3Q16798 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ME3Q16798 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ME3Q16798 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ME3Q16798 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ME3Q16798 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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