Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HIF1AQ16665 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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HIF1AQ16665 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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