Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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