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Protein–RNA interactions for Protein: Q16143
SNCB, Beta-synuclein, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SNCB
Q16143
RNA5SP133-201
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119 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
RNY1P2-201
ENST00000364820
117 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
RNU6-449P-201
ENST00000383914
107 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
Y_RNA.440-201
ENST00000384120
114 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
RNU6-710P-201
ENST00000410424
105 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
RNU2-14P-201
ENST00000411053
191 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
AC098826.2-201
ENST00000452011
651 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
AC092608.1-201
ENST00000503505
267 nt
TSL 2
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
AC093730.1-201
ENST00000508825
448 nt
TSL 3
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
DEFB131B-201
ENST00000530210
213 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
Y_RNA.757-201
ENST00000578934
114 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
MIR548AG2-201
ENST00000581228
64 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
AC011825.2-201
ENST00000583138
553 nt
TSL 4
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
MIR4499-201
ENST00000584834
69 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
AC020913.3-201
ENST00000594678
125 nt
TSL 3
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
AC027449.1-201
ENST00000608890
407 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
uc_338.10-201
ENST00000621872
182 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
SNCB
Q16143
SNORA36B-201
ENST00000410438
131 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
AC074085.1-201
ENST00000413598
418 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
AF228730.3-201
ENST00000436691
102 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
snoU13.13-201
ENST00000458842
104 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-256P-201
ENST00000516747
97 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
AC005357.1-201
ENST00000588399
301 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
AC011603.4-201
ENST00000611325
277 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MIR376A2-201
ENST00000636782
80 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORD114-29-201
ENST00000364819
70 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-1138P-201
ENST00000365359
106 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-20P-201
ENST00000384106
107 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORD61-201
ENST00000384252
73 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
Y_RNA.486-201
ENST00000384398
107 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MIR626-201
ENST00000385032
94 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORA26.8-201
ENST00000391306
124 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORA13-201
ENST00000458790
133 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-1170P-201
ENST00000515974
106 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
AC009094.1-201
ENST00000564443
426 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
AC040904.1-201
ENST00000590850
223 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
AC069503.3-201
ENST00000618674
145 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORD81.1-201
ENST00000363064
77 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
Y_RNA.189-201
ENST00000363959
112 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-431P-201
ENST00000383874
107 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORD116-9-201
ENST00000384000
95 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORD116-3-201
ENST00000384287
95 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORD116-8-201
ENST00000384365
95 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORD116-7-201
ENST00000384404
95 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORA18-201
ENST00000384416
132 nt
BASIC
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□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORD116-5-201
ENST00000384462
95 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MTND2P9-201
ENST00000422293
931 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
AC098614.3-201
ENST00000438957
440 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
TRAJ51-201
ENST00000504127
63 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MTATP6P24-201
ENST00000576835
677 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MIR4528-201
ENST00000577763
90 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MIR3179-1-201
ENST00000578940
84 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MIR3179-2-201
ENST00000579107
84 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MIR3179-3-201
ENST00000579566
84 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MIR3179-4-201
ENST00000617599
84 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
U6.109-201
ENST00000636749
87 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
Y_RNA.274-201
ENST00000364714
101 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORD116-11-201
ENST00000383882
92 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORD24-201
ENST00000383884
75 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
Y_RNA.416-201
ENST00000384014
113 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MIR1265-201
ENST00000408444
86 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
Y_RNA.615-201
ENST00000410769
117 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-1086P-201
ENST00000410930
100 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU7-141P-201
ENST00000459304
62 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-470P-201
ENST00000515954
104 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-693P-201
ENST00000516134
107 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
AP000676.1-201
ENST00000533307
52 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MTND5P40-201
ENST00000559945
246 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
YWHAEP2-201
ENST00000580066
112 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
CEP57L1-213
ENST00000520883
2055 nt
TSL 5
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
Y_RNA.12-201
ENST00000362393
112 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-502P-201
ENST00000362419
108 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-626P-201
ENST00000363354
107 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNA5SP368-201
ENST00000364298
116 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-1062P-201
ENST00000383908
107 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-154P-201
ENST00000384306
106 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
Y_RNA.530-201
ENST00000384587
101 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MIR599-201
ENST00000385069
95 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MIR519E-201
ENST00000385075
84 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
AL160004.2-201
ENST00000432935
350 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SCARNA18B-201
ENST00000458806
135 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-138P-201
ENST00000515952
107 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORD22.1-201
ENST00000516331
125 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SNORA27.4-201
ENST00000516650
95 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-1258P-201
ENST00000516911
111 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MIR2355-201
ENST00000517199
87 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
AL080274.1-201
ENST00000605565
220 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
DISC2.1-201
ENST00000612827
205 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
uc_338.19-201
ENST00000616808
99 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
AC068137.3-201
ENST00000639191
341 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MIR342-201
ENST00000362212
99 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-888P-201
ENST00000363010
101 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU4-80P-201
ENST00000363200
141 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
Y_RNA.119-201
ENST00000363301
96 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
Y_RNA.133-201
ENST00000363428
110 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNU6-801P-201
ENST00000364087
105 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
MT-TY-201
ENST00000387409
66 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
RNA5SP25-201
ENST00000410815
110 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
SPINT5P-201
ENST00000448174
155 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
SNCB
Q16143
NDUFAF4P4-201
ENST00000454883
502 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
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