Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.18□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
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