Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms