Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PUM3Q15397 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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PUM3Q15397 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PUM3Q15397 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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