Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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COL19A1Q14993 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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COL19A1Q14993 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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COL19A1Q14993 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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COL19A1Q14993 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
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COL19A1Q14993 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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COL19A1Q14993 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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COL19A1Q14993 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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COL19A1Q14993 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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COL19A1Q14993 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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COL19A1Q14993 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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