Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHD4Q14839 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms