Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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GBX1Q14549 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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GBX1Q14549 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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GBX1Q14549 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GBX1Q14549 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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GBX1Q14549 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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GBX1Q14549 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
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GBX1Q14549 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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GBX1Q14549 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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GBX1Q14549 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
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