Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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