Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SCARB2Q14108 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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SCARB2Q14108 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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SCARB2Q14108 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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SCARB2Q14108 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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SCARB2Q14108 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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SCARB2Q14108 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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SCARB2Q14108 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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SCARB2Q14108 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SCARB2Q14108 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
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