Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
GTF2H2Q13888 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF2H2Q13888 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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