Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.91□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
SPTAN1Q13813 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
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