Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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CDH18Q13634 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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CDH18Q13634 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CDH18Q13634 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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CDH18Q13634 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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CDH18Q13634 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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