Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CUL1Q13616 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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