Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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TCIRG1Q13488 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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TCIRG1Q13488 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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TCIRG1Q13488 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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TCIRG1Q13488 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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TCIRG1Q13488 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TCIRG1Q13488 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCIRG1Q13488 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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