Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms