Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.22□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
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