Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NR1H3Q13133 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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NR1H3Q13133 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1H3Q13133 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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