Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ECH1Q13011 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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