Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMPOP42166 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMPOP42166 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMPOP42166 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMPOP42166 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMPOP42166 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMPOP42166 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMPOP42166 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMPOP42166 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TMPOP42166 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMPOP42166 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMPOP42166 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMPOP42166 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMPOP42166 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMPOP42166 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMPOP42166 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMPOP42166 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMPOP42166 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMPOP42166 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMPOP42166 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMPOP42166 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMPOP42166 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMPOP42166 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TMPOP42166 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMPOP42166 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMPOP42166 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMPOP42166 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TMPOP42166 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMPOP42166 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMPOP42166 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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