Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VDRP11473 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VDRP11473 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VDRP11473 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VDRP11473 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VDRP11473 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VDRP11473 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VDRP11473 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VDRP11473 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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