Protein–RNA interactions for Protein: Q96AK3

APOBEC3D, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3DQ96AK3 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOBEC3DQ96AK3 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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