Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SNRNP35Q16560 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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