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Protein–RNA interactions for Protein: Q16384
SSX1, Protein SSX1, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SSX1
Q16384
RNU6-1248P-201
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SSX1
Q16384
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103 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SSX1
Q16384
RNU6-1190P-201
ENST00000410811
104 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SSX1
Q16384
Y_RNA.617-201
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90 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SSX1
Q16384
snoU13.18-201
ENST00000459483
104 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SSX1
Q16384
Y_RNA.660-201
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120 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SSX1
Q16384
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268 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SSX1
Q16384
AL121655.1-201
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308 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SSX1
Q16384
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□□□□□ -2.43
SSX1
Q16384
AC073869.6-201
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341 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SSX1
Q16384
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
Y_RNA.423-201
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
MIR610-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
SNORD93-201
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74 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
RNU4-83P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
RNU6-383P-201
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94 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
POLR2KP2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
AL583859.1-201
ENST00000455871
335 nt
TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
RNU6-559P-201
ENST00000516151
98 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
AC131281.1-201
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164 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
AC122108.2-201
ENST00000611946
526 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
NPPA-AS1_2.1-201
ENST00000618496
149 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
MIR6828-201
ENST00000636181
60 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
MIR330-201
ENST00000362196
94 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
RNU6-1205P-201
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106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
Y_RNA.160-201
ENST00000363677
92 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
RNY3-201
ENST00000365484
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
Y_RNA.486-201
ENST00000384398
107 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
RNU6-127P-201
ENST00000390897
107 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
RNA5SP496-201
ENST00000391240
109 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
AL160004.2-201
ENST00000432935
350 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
MTND1P34-201
ENST00000438556
671 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
SNORD36C-201
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66 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
AC141557.1-201
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400 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
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239 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
AC025253.1-201
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543 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
uc_338.22-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
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□□□□□ -2.44
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Q16384
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SSX1
Q16384
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Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
Y_RNA.439-201
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BASIC
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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BASIC
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SSX1
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SSX1
Q16384
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BASIC
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SSX1
Q16384
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SSX1
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Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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BASIC
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SSX1
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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BASIC
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SSX1
Q16384
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
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□□□□□ -2.44
SSX1
Q16384
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Q16384
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Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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BASIC
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SSX1
Q16384
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TSL 5
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SSX1
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
Q16384
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SSX1
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SSX1
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SSX1
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SSX1
Q16384
Y_RNA.496-201
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101 nt
BASIC
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SSX1
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100 nt
BASIC
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SSX1
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MIR760-201
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SSX1
Q16384
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293 nt
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SSX1
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Q16384
RNU7-129P-201
ENST00000516128
62 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
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