Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC6Q16204 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
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