Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SS18Q15532 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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SS18Q15532 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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SS18Q15532 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SS18Q15532 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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