Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23BQ15437 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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SEC23BQ15437 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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SEC23BQ15437 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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SEC23BQ15437 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23BQ15437 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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