Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX17Q15036 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX17Q15036 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX17Q15036 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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