Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
IRF3Q14653 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRF3Q14653 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.7 ms