Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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PDE6HQ13956 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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PDE6HQ13956 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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PDE6HQ13956 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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PDE6HQ13956 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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PDE6HQ13956 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.5
PDE6HQ13956 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PDE6HQ13956 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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