| RUNX2 | Q13950 | CEP57L1-213 | ENST00000520883 | 2055 nt | TSL 5 BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PPP1R3A-201 | ENST00000284601 | 4384 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-28-201 | ENST00000363931 | 81 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-978P-201 | ENST00000364371 | 103 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.494-201 | ENST00000384432 | 111 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR520C-201 | ENST00000385005 | 87 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA26-201 | ENST00000391286 | 122 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-955P-201 | ENST00000410497 | 104 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-321P-201 | ENST00000410912 | 106 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL365434.1-201 | ENST00000412362 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL135923.1-201 | ENST00000413066 | 196 nt | TSL 3 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02514-201 | ENST00000509058 | 498 nt | TSL 3 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-13P-201 | ENST00000515909 | 113 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-43P-201 | ENST00000516554 | 64 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPS18CP4-201 | ENST00000535821 | 231 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ36-201 | ENST00000614481 | 58 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01068-202 | ENST00000620874 | 626 nt | TSL 3 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GNPDA2-204 | ENST00000509756 | 5382 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF209P-201 | ENST00000593450 | 2304 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.37-201 | ENST00000362606 | 108 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.226-201 | ENST00000364337 | 114 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA1-201 | ENST00000384107 | 130 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.785-201 | ENST00000384290 | 109 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1287-201 | ENST00000408492 | 90 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AF228730.3-201 | ENST00000436691 | 102 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-120P-201 | ENST00000459334 | 63 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC078980.1-201 | ENST00000485384 | 262 nt | TSL 2 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP61-201 | ENST00000516453 | 100 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.700-201 | ENST00000516806 | 100 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-92P-201 | ENST00000517017 | 135 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGLVVI-22-1-201 | ENST00000521183 | 211 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP002392.1-201 | ENST00000537692 | 208 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3671-201 | ENST00000580455 | 88 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GNAS-AS1_4.1-201 | ENST00000616546 | 112 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR376A2-201 | ENST00000636782 | 80 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C9orf84-205 | ENST00000394779 | 5060 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00643-201 | ENST00000334389 | 3247 nt | TSL 2 BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-682P-201 | ENST00000363843 | 106 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-643P-201 | ENST00000384018 | 107 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR570-201 | ENST00000384917 | 97 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.793-201 | ENST00000411222 | 111 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL138752.1-201 | ENST00000452964 | 351 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-95P-201 | ENST00000459222 | 64 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC048334.1-201 | ENST00000477975 | 159 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005840.1-201 | ENST00000498412 | 377 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-947P-201 | ENST00000516264 | 106 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD36C-201 | ENST00000516733 | 66 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-794P-201 | ENST00000517261 | 64 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA81.3-201 | ENST00000517283 | 198 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC072026.1-201 | ENST00000605023 | 201 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL161722.3-201 | ENST00000605789 | 2983 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UHRF1BP1L-203 | ENST00000545232 | 4088 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.29-201 | ENST00000362570 | 113 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF468-202 | ENST00000396409 | 384 nt | TSL 5 BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003716.2-201 | ENST00000528260 | 108 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004792.1-201 | ENST00000614523 | 137 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008133.2-201 | ENST00000624540 | 351 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.363-201 | ENST00000365529 | 113 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD77.3-201 | ENST00000391113 | 65 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU5E-9P-201 | ENST00000411164 | 104 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC245047.7-201 | ENST00000440265 | 293 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-861P-201 | ENST00000516745 | 106 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4431-201 | ENST00000579990 | 94 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR378D2-201 | ENST00000580636 | 98 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL365205.2-201 | ENST00000594586 | 68 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP327-201 | ENST00000362494 | 101 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.240-201 | ENST00000364469 | 95 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA25.9-201 | ENST00000365087 | 128 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.370-201 | ENST00000365589 | 108 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA79-201 | ENST00000408376 | 140 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1302-7-201 | ENST00000408841 | 72 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P15-201 | ENST00000434246 | 349 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SEPT7P4-201 | ENST00000437076 | 306 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087499.4-201 | ENST00000448505 | 178 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL39P39-201 | ENST00000455840 | 151 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS26P48-201 | ENST00000491713 | 339 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA31.2-201 | ENST00000516019 | 134 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA18.4-201 | ENST00000516440 | 124 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003484.1-201 | ENST00000530974 | 250 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4791-201 | ENST00000607666 | 84 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC134878.1-201 | ENST00000619901 | 243 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZGRF1-208 | ENST00000505019 | 6652 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-34-201 | ENST00000362441 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-12-201 | ENST00000362583 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-29-201 | ENST00000362834 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-9-201 | ENST00000362912 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-21-201 | ENST00000362963 | 81 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-14-201 | ENST00000363090 | 81 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-13-201 | ENST00000363358 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-41-201 | ENST00000363608 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-11-201 | ENST00000363616 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-5-201 | ENST00000363633 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-39-201 | ENST00000363694 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-4-201 | ENST00000363810 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-16-201 | ENST00000363887 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-6-201 | ENST00000363942 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-42-201 | ENST00000364273 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-312P-201 | ENST00000364629 | 107 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-15-201 | ENST00000364809 | 81 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-1-201 | ENST00000364961 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |