Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
APOFQ13790 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
APOFQ13790 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
APOFQ13790 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
APOFQ13790 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
APOFQ13790 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
APOFQ13790 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
APOFQ13790 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
APOFQ13790 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
APOFQ13790 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
APOFQ13790 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
APOFQ13790 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
APOFQ13790 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
APOFQ13790 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
APOFQ13790 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms