Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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ALCAMQ13740 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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ALCAMQ13740 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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ALCAMQ13740 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.29
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ALCAMQ13740 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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ALCAMQ13740 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
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ALCAMQ13740 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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ALCAMQ13740 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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ALCAMQ13740 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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ALCAMQ13740 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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ALCAMQ13740 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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ALCAMQ13740 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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