Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXE3Q13461 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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FOXE3Q13461 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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FOXE3Q13461 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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FOXE3Q13461 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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FOXE3Q13461 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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FOXE3Q13461 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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FOXE3Q13461 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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