Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
NME3Q13232 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NME3Q13232 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NME3Q13232 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NME3Q13232 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NME3Q13232 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NME3Q13232 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NME3Q13232 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NME3Q13232 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NME3Q13232 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NME3Q13232 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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