Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms